Patříme mezi deset největších muzeí v České republice. Spravujeme přes 2,5 milionů sbírkových předmětů v oborech archeologie, historie a přírodních věd. Naše činnost však zdaleka nekončí u zdí ikonické Kotěrovy budovy.
Naší součástí jsou i budovy v areálu Gayerových kasáren a spravujeme Muzeum války 1866 na Chlumu.
Jsme registrovanou vědecko-výzkumnou organizací, pro veřejnost provozujeme odbornou knihovnu a ostatním muzeím v kraji i mimo něj poskytujeme vzdělávací služby. Působíme jako krajské centrum pro digitalizaci, konzervaci, restaurování a péči o živé kulturní dědictví. Také jsme největší neuniverzitní archeologická organizace na území kraje.
